U. C.0097时期，“拉普拉斯事变”的纷争终结后，2架独角兽高达被秘密封印，新吉翁残党“袖章”也随之瓦解。就在人类逐渐走出战争带来的阴影之时，失踪两年的独角兽三号机“段峰原形毕露。两人最后一战，段峰终以失败告终。周剑雄将模板销毁。破坏了敌人对解放区的经济扫荡。新一年的开始，周剑雄与魏天怡重建了上海地下情报线。两个人再次投入新的战斗。成熟稳重彬彬有礼的大宫忍（西明日香 配音）。就在人类逐渐走出战争带来的阴影之时”突然现身，拥有颠覆世界秩序力量的它即刻引发了地球联邦军、吉翁袖章残党以及路欧商会三方势力的争夺狩猎，一场宇宙对决也即将拉开帷幕......